شرایط آب و هوایی شهر باغبادران؛ خشک و مشابه با دیگر بخشهای مرکزی فلات ایران می باشد. هوای این منطقه در تابستان خشک وگرم و در زمستانها مرطوب و سرد میباشد. بخش اعظم بارندگی در این منطقه مرطوب به جریانات مدیترانه ای است. این بارندگی ها از سمت غرب و از اوایل پاییز تا اواسط بهار منطقه را تحت تاثیر خود قرار میدهد. وجود رودخانه زاینده رود با مجموع ۵۹۳ لیتر موجب سرسبزی و غنای باغات، بیشه زارها و مزارع شهر گردیده است. زاینده رود سبب تقویت آبهای زیر زمینی شده و عامل اساسی اعتدال هوا در منطقه بشمار میرود.
علاوه برآن وجود نواحی مرتفع غربی رطوبت هوا را بشدت کاهش میدهد. همین امر آب و هوای منطقه را در گروه آب و هوای شبیه مدیترانه ای قرار داده است. تفاوت کمترین و بیشترین میزان درجه حرارت در گرمترین ماه فصل تابستان ۴/۲۵ درجه سانتی گراد میباشد.
بر اساس آمار هواشناسی ایستگاه پل کله میانگین دمای سالانه منطقه ۴/۱۳ درجه سانتیگراد است، گرمترین ماه سال تیرماه وسردترین ماه سال دی میباشد، معدل دما ۳۴ درجه سانتیگراد در تیر ماه وحداقل دما ۵ درجه سانتیگراد در دیماه است.